Российский стартап UNIM, портфельная компания ФРИИ, разработала и обучила нейросеть, которая автоматизирует один из этапов диагностики онкологических заболеваний — подсчет индекса Ki-67, который определяет скорость роста опухоли.
Нейросеть сокращает объем рабочего времени врача, затраченного на процесс определения этой характеристики и повышает точность результата. Обычно у врача работа со снимком занимает 15 минут, нейросеть сокращает этот процесс до 30 секунд. Ошибка всего лишь в одной характеристике Ki-67 будет означать, что пациенту могут оказать недостаточный объем медицинской помощи, и через полгода может произойти рецидив. Или наоборот, дадут избыточное лечение, что крайне вредно для здоровья.
Нейросеть создана на базе анализа более 40 терабайт диагностических данных и уже применяется в лаборатории стартапа в тестовом режиме. С помощью технологии просмотрены и уже оценены материалы более 200 диагностированных пациентов. По данным Министерства здравоохранения, число больных раком в России в 2017 году достигло 3,5 млн, такой диагноз впервые ежегодно получает около 600 тысяч россиян.
Разработанная нейросеть обеспечивает точность 95%, что выше показателя постановки диагноза врачом. «Мы сделали нейросеть, которая считает общее количество клеток в материале и, определив сколько из них экспрессирует Ki67, дает эту информацию врачу. До появления нейросетей сделать это при помощи классических математических методов было крайне сложно. Препараты были не стандартизированы и результаты могли отличаться», — пояснил основатель Unim Алексей Ремез.
«Оценка пролиферативной активности опухоли с помощью измерения пропорции Кi67 позитивных клеток имеет решающее значение для выбора лечения при ряде онкологических нозологий, включая рак молочной железы и нейроэндокринные опухоли. Введение автоматической оценки с использованием нейросети в сотни раз сокращает объем рабочего времени врача, затраченного на этот процесс», — говорит врач-патологоанатом, кандидат медицинских наук профессор Андрей Вальков (Университетская клиника Северной Норвегии).
Скриншот из системы UNIM: так нейросеть распознаёт клетки и ведёт их подсчёт. Обычно соотношение коричневых к сиреневым клеткам врачи считают вручную.
Компания UNIM запустилась в 2013 году. Облачную платформу Digital Pathology©, разработанную компанией, используют сотни врачей и пациентов из России, стран Азии, Западной Европы и США. Компания разрабатывает принципиально новые инструменты для диагностики онкологических заболеваний. Инвесторы компании — ФРИИ, Medme, Алексей Басов. UNIM является резидентом Сколково. В этом году компания запустила собственную цифровую патоморфологическую лабораторию UNIM.
С помощью патоморфологической платформы врачи просматривают и хранят сканированные изображения гистологических препаратов. В программном обеспечении профессиональные высококлассные специализированных докторов патологоанатомов, которым предоставлены инструменты для совместной работы над каждым диагностическим случаем, попадающим на платформу.